相关文献举例

　　实验目的：

　　1、得到通光藤转录组；

　　2、挖掘通关藤药用成分多氧孕烷生物合成机制；

　　3、开发SSR分子标记。

　　实验材料：一个样本，通关藤的茎与叶混样。

　　实验结果：

　　1. 测序得到63,175,764条Clean reads，拼接成65,796条Unigenes,获得通关藤的转录组参考序列；

　　2.对得到的Unigenes进行注释，功能分类后发现27条Unigenes与孕烷合成代谢相关；6条与多氧孕烷合成相关基因中5条在叶中表达量上调，说明多氧孕烷前体可能先在叶中合成，而后运输到茎中进行后续修饰并储存；

　　3. 对孕烷修饰相关基因3-O-葡糖基转移酶进行了家族树分析，找出7条基因在物种间同源，证明了该基因的功能。

　　实验目的：

　　1、得到灯盏花转录组参考序列数据；

　　2、发现与野黄芩苷、绿原酸生物合成及转录调节相关的候选基因；

　　3、寻找简单重复序列（SSR）标记，为该植物的分子标记辅助育种提供便利。

　　实验材料：一年生的成熟期的叶和花组织

　　实验结果：

　　1.测序得到62,595,942条Clean reads，拼接成73,029条Unigenes,获得灯盏花的转录组参考序列；

　　2.得到的unigenes比对Nr,SwissProt,KEGG,COG数据库后，发现与野黄芩苷、绿原酸生物合成及转录调节相关的候选基因；通过进化分析发现黄酮类特异性转录因子R2R3 – MYB。

　　3.通过鉴定SSR获得大量基因标记，最终在遗传相似度上将13个品种分为3个组为灯盏花的分子育种与基因应用提供了有有利具。

　　实验目的：通过构建幼年和成年两个铁皮石斛转录组参考序列数据库，比较差异基因，找出与次生代谢物多糖合成相关的基因。

　　实验取材：发芽后10月幼株一株；幼株移植18月后的成株一株。

　　实验结果：

　　1.得到幼年和成年两个铁皮石斛转录组参考序列,并分析得到不同成长阶段的差异基因；

　　2.发现大量与糖基转移酶、纤维素转移酶合成代谢通路相关的基因；

　　3.比较幼年和成年株的铁皮株斛中与多糖合成代谢相关的差异基因，发现是由GT家族TF家族中的多种基因共同参与调解其次生代谢通路。

　　做新时代的中药材

　　随着测序技术的不断完善，成本的不断降低，高通量测序技术对传统黄金玛卡的基因组序列完善、关键基因结构、表达及功能信息的挖掘，将成为黄金玛卡的生长发育、关键次生代谢物合成代谢等生物学过程研究的必经之路，为中药材的研究奠定更加坚实的分子机制的理论基础。

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